先日応募した企業から携帯に電話があり、留守電に「改めて連絡しますとメッセージが入っていました。数時間経過しましたが、まだかかってきません。このまま待っていていいのでしょうか？

「また連絡します」といったメッセージが残っていても、出られなかった場合は、電話はかけ直すのがマナーです。

電話ができる状態になったら掛けなおし、一言お詫びを添えましょう。
「エンバイトより応募しました、○○と申します。本日の△時ごろに、お電話を頂いた件で折り返しご連絡をしました。□□さまはいらっしゃいますか？」といった伝え方をすればスムーズに話が通じるかと思います。

また、折り返し連絡をする場合は次の点を気をつけましょう。

1.企業の営業日や応募受付時間内に連絡をすること
（遅くなってしまった場合は翌日に）
2.面接の時間や持ち物などをひかえられるように、メモを準備すること
3.電話が繋がった時は、きちんと自分の名前を名乗ること

上記を参考に、好印象となるような対応を心がけてください。